Первые упоминания о поселении в урочище реки Алымки относятся ко временам освоении Сибири. Кто-то бежал от крепостного права, кого-то отправляли по царскому указу. Приблизительно в начале XVIII века появилось поселение на р. Алымка, которое служило перевалочным пунктом (по некоторым данным «Алымка» в переводе с татарского означает «пошлина, дань»). Максимовка, Трошина, Лучкина получили свои названия от имени первых жителей, а Яр – по месту расположения - крутой берег.

Селение Алымка было крупнее близлежащих поселений. В XIX веке появились семьи зажиточных крестьян братьев Якова и Александра Шехиревых. А в 1870-1872 гг. на деньги их отца Василия в Алымке была построена первая церковь.

Селение Алымка по архивным данным на 1903 год состояло из 48 дворов (136 мужчин, 168 женщин). В селе был волостной пристав, работали почта, управление сельского банка, церковно-приходская школа, две торговые лавки и хлебозаготовительный магазин.

1917 год. Алымка оказалась в оккупации армии Колчака. Многие бежали в лес к партизанам. Местных жителей обязали снабжать провиантом и транспортом белогвардейцев. Староста Василий Шехирев стоял на стороне армии Колчака.

1928 год. В Алымке создана коммуна «Путь Ленина», в которую объединились жители Алымки, Максимовки, Трошиной, Лучкиной, Яра. Часть урожая отдавалась государству. Появлялись первые сельскохозяйственные машины. Иметь личное хозяйство запрещалось.

В 1938 году создана первая Алымская МТС: на полях появились комбайны, тракторы, выросла численность населения. Школа стала четырехлетней. Весной 1941 года – самое крупное наводнение в истории села: хлеб и картофель не сажали, скот кормили талом. Вслед за бедой пришла следующая – война. Мужчины ушли на фронт, всю тяжелую работу взвалили на свои плечи женщины и дети. Незначительный подъем благосостояния села перед войной оказался сломлен на долгие военные годы.

В 1950 году алымский, трошинский, яровской, лучкинский, черпиинский и красноярский колхозы объединяются в одно хозяйство. А с 1959 года – в артель им. Чапаева. Построено новое школьное здание. Кроме артели, на территории Алымского поселения работал рыбоучасток.

В 1960-е годы в Алымке стояла геологоразведка. Построены жилые дома, магазин.

1970-80-е гг. для рабочих совхоза «Алымский» построены улицы новых двухквартирных домов, здание совхозной конторы, в двухэтажном здании детского сада разместили почту, библиотеку, дом культуры и пункт милиции.

В 1996 году построено новое школьное здание.